Description du test
Discrimination par des analyses de biologie moléculaire des souches de Campylobacter jejuni ou coli adressées au Centre National de Référence dans le cadre de l’investigation de situations épidémiques ou pour l’étude de l’écologie globale des campylobactérioses en Belgique.
But du test
En fonction des situations, le laboratoire peut mettre en œuvre les méthodes moléculaires suivantes :
- PCR-Binary Typing : Cette méthode développée récemment permet de réaliser un premier screening de l’écologie des campylobacterioses. Cette méthode peut-être complétée par des techniques de Pulsed field gel electrophoresis (PFGE) et/ou de Multi Locus Sequence Typing (MLST) si nécessaire.
- PFGE : Cette méthode développée au sein du réseau Campynet peut être mise en œuvre dans le cadre d’investigation d’épidémie.
- MLST : Cette méthode permet de comparer des souches de différents laboratoires dans le cadre de la surveillance internationales des infections à Campylobacter.
Critères pour effectuer ce test dans le cadre des activités de référence
Le typage moléculaire sera réalisé à la demande dans le cadre de l’investigation de situations épidémiques ou dans le cadre d’enquêtes épidémiologiques.
Instructions sur les échantillons
Prélèvement source :
- Selles
- Sang
Echantillons acceptés :
- Souches de Campylobacter (min. 2)
Conditions d’envoi :
- La viabilité de Campylobacter étant limitée, privilégier des cultures jeunes pour l’envoi (24 à 48h).
Instructions sur le transport
Par la poste : envoi du lundi au mercredi
Par porteur : du lundi au vendredi midi
- Boîtes ou tubes bien fermés,
- Emballés avec un matériel absorbant dans un emballage secondaire.
- L’utilisation d’un système générateur d’atmosphère microaérophile est recommandé
- Le tout est ensuite placé dans une enveloppe ou une boîte et envoyé selon les règlementations applicables au transport des matières infectieuses.
Demandes non acceptées
- Stockage ou transport incorrect : Campylobacter ne peut survivre pendant un long transport, son isolement peut être compromis par le développement de la forme viable mais non cultivable.
- En l’absence d’information précise sur les souches que vous envoyez, le CNR Campylobacter ne peut que partiellement remplir les missions qui lui sont fixées. Nous vous remercions dès lors de compléter les formulaires le plus adéquatement possible.
Délai pour recevoir le résultat des tests (et fréquence d’analyse)
Les échantillons sont traités à l’arrivée au CNR (entre 8h et 16h).
Jours d’analyse : LU-MA-ME-JE-VE.
Le TAT médian est de 7 jours; maximum 3 semaines sauf pour les analyses de biologie moléculaires pour lesquelles un délai supplémentaire est réquis. Contacter le CNR pour les cas urgents.
Communication des résultats des tests
Les résultats seront transmis dans les délais précités.
Les protocoles seront transmis par courrier postal.
Les non conformités et résultats urgents pourront être transmis par téléphone ou par courriel.