Identification d'une mycobactérie atypique en culture par une technique de biologie moléculaire

Description du test

Toute espèce de mycobactérie atypique sera recherchée dans une culture mycobactérienne ne contenant pas d’ADN du complexe M.tuberculosis. Plusieurs techniques peuvent être utilisées selon l’espèce mycobactérienne en croissance: PCRs spécifiques de différentes espèces, PCR suivie de séquençage d’un fragment de l’ADN codant pour l’ARNr 16S, PCR suivie d’hybridation inverse (kits commerciaux Inno-Lipa Mycobacteria ou GenoType Mycobacterium).

Résultat : identification de l’espèce mycobactérienne.

But du test

Identification de cultures de mycobactéries atypiques ou NTM (Non Tuberculous Mycobacteria) dans un but diagnostique.

Critères pour effectuer ce test dans le cadre des activités de référence

Confirmation d’identification requise par l’état clinique du patient.

Instructions sur les échantillons

Type : Culture de mycobactéries sur milieu spécifique liquide ou solide ou exceptionnellement ADN extrait d’un échantillon positif à l’examen direct (bacilles acido-alcoolo-résistants).

Quantité minimale: Culture : 3-5 ml ou 1 tube (milieu solide) ; Extrait d’ADN : 80-100 µl.

Instructions sur le transport

Acheminement dans un triple emballage et à température ambiante. (En effet, l’expérience a montré que l’envoi à température ambiante n’altère pas la qualité de la culture ou ADN extrait)

Le récipient doit être fermé hermétiquement.

Demandes non acceptées

Echantillon abîmé, de volume insuffisant ou ayant coulé dans l’emballage.

Délai pour recevoir le résultat des tests (et fréquence d’analyse)

Délais : 21 jours ouvrables

Jours d’analyse : LU-MA-ME-JE-VE.

Communication des résultats des tests  

• Un rapport d’analyse est envoyé pour chaque demande d’analyse reçue​
• Si, lors de la réception de l’échantillon, celui-ci est endommagé à un point tel que son analyse s’avère impossible, le demandeur sera contacté et un formulaire standard lui sera envoyé (au lieu d’un rapport d’analyse).