Test de résistance au VHC : séquençage NS5B (CUSL)

Last updated on 12-7-2023 by Charlien Hupko

Description du test  

Précisions :
  • Recherche des mutations de résistance du virus de l’hépatite C aux antiviraux par séquençage de la gène NS5B.
  • Détermination par NGS (Next-Generation Sequencing) avec le test Sentosa® SQ HCV Genotyping Kit v2.0 de Vela Diagnostics (Ion Torrent).
  • Sensibilité >90% pour génotypes 1a, 1b et 3a, sensibilité >70% pour autre génotype.
Résultat : 
Qualitatif (Sensible/Résistant/sensibilité intermédiaire/indéterminé).
Résultat interprété pour chaque antiviral dont les données d’interprétation sont publiées.

But du test 

Recherche des mutations de résistance du virus de l’hépatite C par NGS en vue de déterminer sa sensibilité aux antiviraux utilisés pour le traitement de l’hépatite virale C.

Critères pour effectuer ce test dans le cadre des activités de référence 

Effectué uniquement sur des prélèvements RT-qPCR-positifs dans le cadre d’un cas probable de résistance aux antiviraux avec indications virologiques et cliniques de résistance thérapeutique chez un patient sous traitement.
Les résultats de charge virale (minimum 1000 UI/mL) et du génotype obtenus par le laboratoire demandeur ainsi que les antiviraux donnés sont à indiquer sur le formulaire de demande CNR.

Instructions relatives aux échantillons 

  • Type : Plasma EDTA ou Sérum 
  • Conditions de conservation et d’acheminement : Conservation à -20°C avant envoi, centrifuger dans les 6h. 
  • Quantité idéale : 1 ml. Quantité minimale : 0,5 ml.

Instructions relatives au transport 

Acheminement dans un triple emballage et à -20°C.
Le récipient doit être fermé hermétiquement.

Demandes non acceptées 

  • Absence d’indications cliniques ou virologiques de résistance thérapeutique chez un patient en traitement sur le formulaire de demande.
  • Absence du formulaire de demande CNR ou formulaire incomplet.

Délai pour recevoir le résultat des tests (et fréquence d’analyse)

Délai  : 30 jours ouvrables
Fréquence d’analyse : lundi au jeudi.

Communication des résultats des tests 

  • Un rapport d’analyse (papier) est envoyé pour chaque demande d’analyse reçue.
  • Si, lors de la réception de l’échantillon, celui-ci est endommagé à un point tel que son analyse s’avère impossible, le demandeur sera averti via le rapport d’analyse. 

Pathogen info

Pathogen(s): 
Hépatite C virus
Maladie: 
Hépatite C

Accréditation

Is the analysis accredited?

Materials and methods

Material(s): 
Method reference: 
-

Turnaround time and time slots

Turnaround time: 
20 days

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Medical

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