Last updated on 20-7-2023 by Lee Mbambu Maswaku
Description du test
Description
- Extraction de l’ADN génomique de la souche pure, à l’aide de billes magnétiques
- Séquençage accrédité ISO (short-reads)
- Analyse avec des outils bioinformatiques internes
Resultat:
Typage complet de la souche, y compris profil cgMLST et gènes de résistance aux antibiotiques.
But du test
Identification des sous-espèces et/ou profil cgMLST.
Critères pour effectuer ce test dans le cadre des activités de référence
Typage fin ou regroupement phylogénétique des souches dans le contexte de la recherche sur les épidémies.
Instructions sur les échantillons
- Type: Le demandeur envoie une souche isolée et purifiée dans un tube de transport (moyen). D’autre part, une culture en milieu liquide ou solide ou, exceptionnellement, un extrait d’ADN d’un échantillon.
- Quantité minimale: Ne pas appliquer
Instructions sur le transport
Les échantillons doivent être emballés dans un double emballage et conservés à température ambiante. Le récipient doit être hermétiquement fermé.
Demandes non acceptées
Ne pas appliquer.
Délai pour recevoir le résultat des tests (et fréquence d’analyse)
- Délai: 25 jours
- Jours d’analyse: Tous les jours de la semain (hors week-ends prolongés, jours fériés et la période entre Noël et le Nouvel An)
Rapporter les résultats
Le rapport d’analyse est envoyé de la manière souhaitée par le demandeur.
Pathogen info
Pathogen(s):
Souches bactériennes
Accréditation
Is the analysis accredited?
Materials and methods
Material(s):
Method reference:
-
Turnaround time and time slots
Turnaround time:
25 days
Contact person(s)
-
An Van den Bossche, MSc, PhDScientifique
-
Wesley Mattheus, MScLab Responsible
Analysis categories
Medical