Description du test
Identification au moyen de la spectrométrie de masse MALDI-TOF. Des tests biochimiques sont nécessaires pour l’identification des sous-espèces de C. diphtheriae.
- La qPCR pour le gène tox peut immédiatement avoir lieu sur une culture pure de corynebacteria suspectés. En cas de résultat positif, la production de toxines sera encore déterminée par la suite (certaines souches possèdent un gène muté avec un codon stop qui bloque la synthèse des protéines).
- Une qPCR pour la détection de l’ADN de C. diphtheriae, C. ulcerans, et C. pseudotuberculosis, ainsi que du gène tox, peut être éffectuée directement sur un échantillon clinique.
- Typage des isolats C. diphtheriae par whole genome sequencing (WGS)
- Antibiogramme par le biais de l’E-test.
But du test
Confirmation du diagnostic et étude de l’épidémie.
Critères pour réaliser ces analyses dans le cadre des activités de référence
Tous les isolats suspects sont acceptés. Pour la qPCR sur échantillon, les frottis respiratoires et cutanés sont acceptés, en cas de forte suspicion et après contact avec le CNR. En cas de confirmation de l’identification et/ou de la présence du gènes tox, une détermination de la sensibilité et un typage approfondi seront effectués si un isolat est disponible. La production de la toxine est également confirmée. .
Instructions concernant les échantillons
- Échantillonnage (quels spécimens, volume) : culture pure ou frottis respiratoires ou cutanés.
- Conditions de conservation (température, temps, …) : transport de l’échantillon le plus rapidement possible au CNR.
Instructions sur le transport
- Conditions de transport : température ambiante, <24 heures
- Spécifications du mode de transport : frottis sur milieux Amies o eSwab ou culture pure
Aucun matériel de prélèvement n’est prévu par le CNR.
Demandes non acceptées
Ne pas applicable.
Délai pour recevoir les résultats d’analyses (et fréquence d’analyses)
Selon les besoins cliniques et l’impact de santé publique.
Si la culture est pure et récente, après 24 heures, une identification provisoire pourra être établie et on aura les résultats de la PCR pour le gène tox.
Communication des résultats de tests
- Par téléphone et courrier électronique sécurisé en cas de résultat positif de la PCR
- Par la poste en cas de résultat négatif.