Identificatie, toxinebepaling, typering van Corynebacterium diphtheriae en andere toxinogene corynebacteria (C. ulcerans en C. pseudotuberculosis)

Beschrijving van de test     

Identificatie door middel van MALDI-TOF massa spectrometrie. Biochemische testen zijn noodzakelijk voor de bepaling van het subspecies van C. diphtheriae.

• qPCR voor het tox-gen kan onmiddellijk gebeuren op een zuivere kweek van verdachte corynebacteria. Bij een positief resultaat zal de productie van het toxine later nog bepaald worden (sommige stammen bezitten een gemuteerd gen met een stop codon dat de eiwitsynthese blokkeert).
• qPCR voor de detectie van DNA van C. diphtheriae, C. ulcerans, en C. pseudotuberculosis, alsook de aanwezigheid van het tox-gen, kan onmiddellijk gebeuren op een klinisch staal.
• Typering van isolaten door middel van whole genome sequencing (WGS)
• Antibiogram door middel van Etest op isolaten.

Doel van de test

Bevestiging van de diagnose en onderzoek van uitbraak.

Criteria om de analysen uit te voeren in het kader van de referentieactiviteit.

Alle verdachte isolaten worden aanvaard. Voor qPCR op staal worden respiratoire en cutane uitstrijken aanvaard, in geval van sterk vermoeden en na contact met het NRC. Bij bevestiging van identificatie en aanwezigheid van het tox-gen zal een gevoeligheidsbepaling en een verdere typering worden uitgevoerd, voor zover een isolaat beschikbaar is. Tevens wordt een bevestiging van toxineproductie uitgevoerd.

Instructies voor monsters

• Staalafname: zuivere kweek of respiratoire uitstrijken of uitstrijken van huidletsels
• Bewaarcondities: transporteer het monster zo snel mogelijk naar het referentielaboratorium.

Instructies voor transport

• Transportcondities: kamertemperatuur, <24 uur
• Specificaties voor transport medium: wisser in een gelmedium (Amies) of eSwab of zuivere kweek.

Er wordt door het NRC geen afnamemateriaal voorzien

Onaanvaardbare aanvragen

Niet van toepassing

Turn around time (en frequentie van analyse)

Afhankelijk van klinische nood en impact op de volksgezondheid.

Rapportering van testresultaten

• Telefonisch, per beveilide elektronische post en post in geval van een PCR positief resultaat.
• Per post in geval van een negatief resultaat