De dienst Epidemiologie van infectieziekten neemt deel aan de surveillance van rotavirusinfecties aan de hand van door de peillaboratoria verzamelde gegevens. Deze surveillance gebeurt in samenwerking met het nationaal referentiecentrum voor het rotavirus, dat de in België circulerende rotavirusstammen analyseert.
Aan de hand van de analyse van de gegevens van de peillaboratoria en het nationaal referentiecentrum, maar ook van andere databanken, kunnen we de ontwikkeling van dit pathogeen volgen, een beter inzicht krijgen in de verspreiding van het pathogeen per leeftijd, geografische regio, enz., en de invloed van het rotavirus op de volksgezondheid beter begrijpen. Dit is vooral belangrijk om het effect van de in 2006 ingevoerde vaccinatie bij zuigelingen te kunnen volgen.
Deze gegevens worden ook gebruikt door de gewesten, het Europees Centrum voor ziektepreventie en -bestrijding (ECDC) en andere gezondheidsactoren.
Elk jaar publiceert Sciensano een jaarrapport over de surveillance van rotavirusinfecties.
De dienst Kwaliteit van vaccins en bloedproducten van Sciensano is erkend als Belgisch officieel laboratorium voor geneesmiddelencontrole (OMCL — Official Medicines Control Laboratory) en is verantwoordelijk voor de kwaliteitscontrole van rotavirusvaccins voordat zij op de Europese markt mogen worden gebracht.