Last updated on 4-3-2025 by Amber Van Laer
Beschrijving van de test:
- Moleculaire typering van enterokokken via whole genome sequencing (WGS) van enterokokken. Op basis van de bekomen sequenties wordt het MLST-type bepaald.
- Typering in de diepte gebeurt aan de hand van het core genome in combinatie met epidemiologische data.
Doel van test WGS
Bepalen van het sequentie-type en clonale verwantschap
Criteria voor het uitvoeren van deze test
- Zie identificatie enterokokken
- Meer dan 1 stam moet beschikbaar zijn en vermoeden van een uitbraak, enkel na contact met referentiecentrum (referentiecentrum@uza.be).
Geschikte monsters
Reinkweek op plaat met individuele kolonies
Instructies voor transport
Zie identificatie enterokokken
Onaanvaardbare aanvragen
- Geen reinkweek
- Onvolledig aanvraagformulier
Turn around time en analysefrequentie:
- Analysefrequentie: Per volledige run tenzij uitbraak (contacteer het NRC indien uitbraak)
- Turn around time: contacteer het referentiecentrum
Rapportering van testresultaten
- Hoe: via fax
- Wanneer: als volledig analyseresultaat gekend is
Accreditatie
Is the analysis accredited?
Materials and methods
Material(s):
Method reference:
-
Request forms
URL to form(s):
Analysis categories
Medical